细菌性肠炎主要是因大肠杆菌或沙门氏菌感染从而引起。其症状为：病虾消化道呈红色，胃部最明显，中肠变红并肿胀，直肠（后肠）变混浊，界限不清。病虾活力减弱、厌食、生长慢。此病主要发生在春夏季节，主要由于水质恶化或饵料腐败所致。
预防：进行清塘消毒。虾苗放养前一定将淤泥清除干净，然后用生石灰彻底消毒，杀灭病原体，减少发病机率。
水质调节：常常使用水质调节制剂进行调水，防止水体和底层有害于人体健康的物质大量积累，施入微生物制剂，以改善水质，提高虾苗的抗病能力，保持水体透明度不低于30公分，利于对虾的生长发育。在调水的同时，间隔使用底质改良剂进行改底，抑制有害菌的过度繁殖。通过施用底质改良剂，改良底质。在养殖过程中，饵料中定期添加活菌微生态制剂“肠泰”，使用本品能大大的提升虾的免疫力，促进有益菌的繁殖，减少发病几率。
治疗：首先，发现疾病后，要注意进行调水和改底，防止疾病进一步恶化。饲料中添加活菌微生态制剂“肠泰”，连用3天~5天；或使用本品进行全池泼洒。
由于虾池蓝藻过多，虾苗吞食蓝藻后难以消化，或消化后有些蓝藻含有内毒素，造成南美白对虾中毒。晚期病虾往往有细菌继发感染。症状基本同细菌性肠炎，两者需要用显微镜进行区别。
预防：预防为主，防止蓝藻形成优势种群。调水改底，防止蓝藻进一步繁殖，避免疾病进一步恶化，调水改底的措施可参照上面的方法。预防的方法和细菌性肠炎相同。
治疗：治疗措施和细菌性肠炎相同。使用活菌微生态制剂具有以下几个方面功效：解毒排毒，如肝中毒、红体病等；对鱼虾的各种肠道疾病有特效，如各种肠炎、消化不良等；增强机体抵抗力，提高机体非特异性免疫力；改善水质。
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